Manafort este investigat de mai multe agenții federale. Biroul Federal de Investigații (FBI) ar fi avut o anchetă penală activă pe numele său încă din 2014 în ceea ce privește afacerile din Ucraina. De asemenea, el este o persoană de interes în ancheta de contraspionaj a FBI care analizează ingerința rusă în alegerile din 2016 din Statele Unite, condusă de Robert Mueller.
Arestare
La 30 octombrie 2017, Manafort s-a predat FBI-ului după ce s-a aflat că a fost pus sub acuzare de un mare juriu federal. Aceștia l-au acuzat pe Manafort de conspirație împotriva Statelor Unite, conspirație în vederea spălării de bani, omisiunea de a depune rapoarte privind conturile bancare și financiare străine, faptul de a fi un agent neînregistrat al unui mandant străin, declarații FARA false și înșelătoare și declarații false.
La 15 iunie 2018, cauțiunea lui Manafort a fost revocată și acesta a fost trimis la închisoare din cauza acuzațiilor de obstrucționare a justiției și de manipulare a martorilor, care ar fi avut loc în timp ce se afla în arest la domiciliu. El a pledat nevinovat la aceste acuzații suplimentare și, din iunie 2018, așteaptă în prezent procesul.
Condamnare
Marți, 21 august 2018, Manafort a fost condamnat pentru cinci capete de acuzare de fraudă fiscală, două capete de acuzare de fraudă bancară și un cap de acuzare de omisiune de raportare a conturilor bancare străine. În total, juriul l-a condamnat pe Manafort pentru 8 dintre cele 18 capete de acuzare formulate împotriva sa și a declarat că nu a ajuns la un punct mort în cazul celorlalte 10 capete de acuzare (judecătorul districtual american T. S. Ellis III a declarat nulitatea procesului pentru aceste acuzații).
