Johnathan James Aitken (n. 24 mai 1978) este un fundaș canadian retras din activitate în hocheiul pe gheață. Aitken a fost selectat pe locul 8 în cadrul NHL Entry Draft 1996 de către Boston Bruins și a jucat trei meciuri pentru aceștia. Pentru sezonul 2000-01 s-a alăturat echipei HC Sparta Praha din Republica Cehă. S-a întors în America de Nord după numai un an și a revenit în NHL în sezonul 2003-04 la Chicago Blackhawks, jucând 41 de meciuri. Ulterior, s-a îndreptat spre Liga austriacă de hochei pentru Klagenfurt AC pentru sezonul 2006-07, înainte de a se retrage din hochei.