Notts County a început în 1862. Clubul a fost înființat înaintea Asociației de Fotbal și la început a jucat un joc cu reguli de club, mai degrabă decât fotbalul de asociație. La începuturile sale, Notts County, la fel ca majoritatea echipelor sportive, era considerat a fi un club "doar pentru domni". Notts County este considerat a fi unul dintre inițiatorii jocului actual, fiind creditat chiar cu inventarea capcanei[] pentru offside. Notts County este cel mai vechi dintre cluburile profesioniste de fotbal din lume (există cluburi profesioniste mai vechi în alte coduri de fotbal). []
La început, clubul a jucat la Park Hollow, la Castelul Nottingham. În decembrie 1864, s-a luat decizia de a juca meciuri împotriva unor echipe din afară și s-a decis că clubul trebuie să găsească un stadion mai mare. După ce a jucat în mai multe locuri, The Magpies s-a stabilit la Trent Bridge Cricket Ground în 1883. Atunci când terenul era folosit pentru Cricket, au jucat la Castle Ground sau la Nottingham Forest's Town Ground. Clubul s-a mutat pe actualul stadion, Meadow Lane, în 1910.
Liga de fotbal
În 1888, Notts County, alături de alte unsprezece cluburi de fotbal, a devenit membru fondator al Ligii de Fotbal. Au terminat primul lor sezon de campionat pe locul 11. Notts County a obținut cea mai bună clasare din istorie în liga a treia în 1890-91, iar zece sezoane mai târziu a terminat tot pe locul trei.
Finala Cupei FA
Pe 25 martie 1891, Notts County a ajuns pentru prima dată în finala Cupei Angliei, dar nu a câștigat. A pierdut cu 3-1 în fața celor de la Blackburn Rovers.
Notts County s-a revanșat în 1894, când a câștigat Cupa Angliei pe Goodison Park pentru prima dată în istoria sa. Magpies au învins Bolton Wanderers cu 4-1, iar Jimmy Logan a marcat primul hat-trick din istoria finalei Cupei FA. Notts County a devenit primul club din afara primei divizii care a câștigat Cupa FA - a terminat pe locul trei în Second Division în acel sezon.