Între 1826 și 1840, Knox a condus școala de anatomie a lui Barclay din Surgeon's Square, Edinburgh. A fost cel mai popular profesor de anatomie din Scoția, dar clasa sa ducea mereu lipsă de cadavre de disecat.
Înainte ca Anatomy Act din 1832 să lărgească oferta, singura sursă legală de cadavre în scopuri anatomice din Regatul Unit erau cele condamnate la moarte și disecate de către instanțe. Acest lucru a dus la o penurie de subiecți legitimi pentru disecție. Lipsa a devenit mai gravă pe măsură ce nevoia de a pregăti studenți la medicină a crescut, iar numărul execuțiilor a scăzut.
În școala sa, Knox s-a confruntat cu această problemă încă de la început, deoarece - după 1815 - Colegiile Regale au sporit studiul anatomiei în cadrul programului de studii medicale. Dacă ar fi predat după ceea ce se numea "metoda franceză", raportul ar fi trebuit să se apropie de un cadavru per elev. În consecință, furtul de cadavre a devenit atât de frecvent încât nu era neobișnuit ca rudele și prietenii unei persoane care tocmai murise să vegheze asupra cadavrului înainte și după înmormântare, pentru a împiedica sustragerea acestuia.
În noiembrie 1827, William Hare a început o nouă carieră când un chiriaș îndatorat a murit din întâmplare. A fost plătit cu 7,10 lire sterline/- (șapte lire și zece șilingi) pentru că i-a livrat cadavrul lui Knox. Acum, Burke și complicele său Hare s-au apucat să ucidă în mod regulat vagabonzi și bețivi. După alte 16 tranzacții, în ceea ce a devenit cunoscut sub numele de Crimele din West Port, la 2 noiembrie 1828 Burke și Hare au fost prinși. Întregul oraș a fost cuprins de groază, alimentată de balade, broadside și ziare, în fața faptelor teribile ale lui Burke și Hare. Hare a transformat dovezile regelui, iar Burke a fost spânzurat, disecat și expus.
Burke e măcelarul, Hare e hoțul,
Knox, băiatul care cumpără carnea de vită!
Knox nu a fost urmărit penal, ceea ce i-a indignat pe mulți din Edinburgh. Casa sa a fost atacată de o mulțime, iar ferestrele au fost sparte. Un comitet al Societății Regale din Edinburgh l-a absolvit de vină, dar nu s-a uitat rolul său în acest caz, iar mulți s-au ferit de el.