În 1961, Norman Scott (n. 12 februarie 1940), un fost model, l-a cunoscut pe Thorpe în timp ce lucra ca grăjdar. El a susținut că el și Thorpe au avut o relație sexuală între 1961 și 1963, când actele homosexuale erau ilegale în Marea Britanie.
În urma cercetărilor, Thorpe și alte trei persoane au fost acuzate de conspirație pentru uciderea lui Scott. În timpul anchetei, un colecționar de arme de foc antice, Dennis Meighan, a mărturisit că a fost angajat de un reprezentant al unei persoane numite "un domn mare din Partidul Liberal" pentru a-l ucide pe Scott pentru 13.500 de lire sterline. Meighan a susținut ulterior că mărturisirea sa orală din 1975 a fost scurtată semnificativ atunci când i-a fost oferită spre semnare: "Am citit declarația, care nu mi-a făcut nici un fel de favoruri, dar nici lui Jeremy Thorpe nu i-a făcut nici un fel de favoruri, pentru că l-a lăsat complet în afara ei...".
Rezumatul judecătorului a fost criticat pe scară largă pentru părtinirea sa și a ajuns pe prima pagină a ziarelor când l-a descris pe Scott drept "un escroc, un mincinos desăvârșit... un escroc". Toți cei patru acuzați au fost achitați la 22 iunie 1979. Dennis Meighan nu a fost niciodată chemat să depună mărturie și a rămas tăcut până în 2014, când și-a recunoscut implicarea și a comentat: "A fost o mușamalizare, fără îndoială, dar îmi convenea".
Afacerea Scott l-a ruinat pe Thorpe, care a demisionat din funcția de lider al Partidului Liberal și a fost învins la următoarele alegeri generale din 1979.