Universitatea Națională din San Marcos (spaniolă: Universidad Nacional Mayor de San Marcos, UNMSM) este o universitate publică din Lima, Peru. A fost fondată la 12 mai 1551. Este prima și cea mai importantă universitate din Peru și cea mai veche universitate din cele două Americi. Universitatea din San Marcos are 20 de facultăți și 62 de școli academice. Înscrie 28.645 de studenți de licență și 3.447 de studenți absolvenți. Universitatea Națională din San Marcos are mulți studenți și absolvenți notabili, inclusiv singurul laureat peruan al Premiului Nobel, Mario Vargas Llosa. Din punct de vedere academic, Universitatea din San Marcos se află pe primul loc în Peru.