Djibouti a participat la Jocurile Olimpice de vară din 2000 de la Sydney, Australia, care au avut loc între 15 septembrie și 1 octombrie. Aceasta a fost a cincea oară când Djibouti a participat la Jocurile Olimpice, de la prima lor participare în 1984, la Los Angeles. Dijibouti a trimis doi atleți la Jocurile Olimpice din 2000, ambii au participat la probele de atletism. Cei doi atleți au fost: Omar Daher Gadid care a concurat la maratonul masculin și Roda Ali Wais care a concurat la 800 de metri feminin. Gadid nu a terminat maratonul, în timp ce Ali Wais nu a trecut de primul tur al probei sale.