Zona făcea parte din Rezervația aborigenă din Australia Centrală la momentul creării acesteia, în 1922. Cu toate acestea, în 1955, granițele rezervației au fost mutate pentru a permite exploatarea minieră și prospectarea, mai ales a nichelului. Taberele miniere au fost înființate în zona din jurul a ceea ce este acum Irrunytju. Ca răspuns, familiile aborigene s-au mutat pentru a se stabili în jurul acestor tabere. Unii au obținut locuri de muncă la mineri și au fost plătiți cu rații de hrană; alții erau acolo pur și simplu pentru a proteja locurile de importanță spirituală de străini. Unele companii au luat măsuri pentru a se asigura că minerii lor respectă aceste situri; alte companii nu au făcut-o, iar mai multe situri sacre au fost deteriorate în această perioadă. Zona a devenit din nou parte a rezervației în 1972.
Odată ce minerii au plecat, familiile aborigene au rămas și au construit o așezare permanentă folosind ceea ce a rămas din taberele miniere (adăposturi, foraje etc.). De asemenea, comunitatea a primit bani de la guvernul federal pentru a ajuta la stabilirea unei așezări permanente. Comunitatea a fost încorporată în 1976. A devenit membră a Consiliului Ngaanyatjarra în 1981.
Irrunytju a rămas pe pământuri aborigene din 1972. Activitățile economice din zonă sunt guvernate de Acordul de utilizare a terenurilor indigene Ngaanyatjarra, încheiat în 2006. Comunitatea menține multe activități tradiționale, cum ar fi vânătoarea și colectarea de bush tucker. Comunitatea are propriul centru de artă, Irrunytju Arts, din 2001.