Departamentul Ñeembucú (spaniolă: Departamento de Ñeembucú) este un departament din Paraguay. Capitala este orașul Pilar. Codul său ISO 3166-2 este PY-12.

Departamentul este aproape în întregime rural, iar unele dintre cele mai vechi și mai bine conservate ruine iezuite se află în apropierea orașului Humaitá.