În iulie 1863, populația Statelor Unite a asistat la cele mai grave revolte din istoria națiunii. În New York City, revoltele au protestat împotriva primului proiect de lege al Americii. Aceștia credeau că această recrutare era nedreaptă. Acesta a avut un mare impact asupra celor săraci și a permis celor bogați să își cumpere o cale de scăpare. Revoltații au distrus mai multe clădiri, inclusiv Azilul de orfani de culoare, și au linșat negri de stâlpii de iluminat. Între 105 și 128 de persoane au murit în timpul celor patru zile de revoltă.
Cântecele lui Foster nu se vânduseră bine în lunile de dinaintea revoltelor. Cele mai bune zile ale sale ca autor de cântece se terminaseră. Publicul său se împărțise pe criterii politice, economice și rasiale. Sâmbătă, 9 ianuarie 1864, Foster s-a simțit rău și s-a dus la culcare devreme. Era cazat într-un hotel sărac, dar decent, de pe Bowery. Duminică dimineața, a vorbit cu o cameristă la ușa lui, apoi s-a întors și a căzut, rupând o bucată de veselă care l-a înjunghiat în gât. Tovarășul său George Cooper (care locuia la doar patru străzi distanță) a fost chemat. L-a găsit pe Foster dezbrăcat într-o baltă de sânge. Compozitorul a șoptit: "Sunt terminat" și a cerut o băutură.
A sosit un medic și rana a fost cusută. Foster a fost îmbrăcată și dusă într-o secție pentru săraci la Spitalul Bellevue. A fost înscris în registru ca "muncitor". Nu se simțea confortabil și nu-i plăcea mâncarea. Pe 13 ianuarie, mânca supă când a leșinat de moarte. Cadavrul său a fost pus într-un sicriu și dus la morga spitalului. În buzunarul său au fost găsite câteva monede și o bucată de hârtie pe care scria: "Dragi prieteni și inimi blânde".
Cauza morții sale nu este cunoscută. Probabil că a fost o combinație de alcoolism, dietă proastă și pierdere de sânge, sau un atac de cord sau un accident vascular cerebral. Jane Foster și frații lui Stephen, Henry și Morrison, au revendicat cadavrul și l-au dus în Pennsylvania pentru înmormântare. Slujba de înmormântare a avut loc în Trinity Episcopal Church, Pittsburgh, la 21 ianuarie. Sicriul lui Foster a fost întâmpinat la cimitirul Allegheny de o fanfară care a cântat melodiile sale. A fost înmormântat lângă tatăl și mama sa.
Moartea sa nu a fost consemnată în majoritatea ziarelor. Cu toate acestea, New York Post a comparat melodiile sale cu cele ale lui Donizetti. The Round Table a scris că Foster era "un scriitor amator" abia familiarizat cu regulile compoziției muzicale. The Table i-a lăudat totuși patetismul și umorul.
Multe cântece au fost promovate după moartea lui Foster ca fiind ultimele sale melodii. "The Voices That are Gone" (publicat în 1865) și "Kiss Me Mother Ere I Die" (1869) sunt probabil, într-adevăr, ultimele sale lucrări. În august 1864, un inginer de origine prusacă a cumpărat The White Cottage și a demolat-o.