Estonia a participat pentru prima dată la Jocurile Olimpice la Jocurile Olimpice de vară din 1920, după ce a devenit independentă față de Rusia în 1918. Comitetul Olimpic Național a fost creat în 1923. Au participat la prima ediție a Jocurilor Olimpice de iarnă din 1924. Sportivii estonieni au participat la Jocurile Olimpice până când țara a devenit parte a Uniunii Sovietice în 1940. În cadrul Jocurilor Olimpice de vară din 1980, regata de navigație a avut loc în capitala Tallinn. Estonia a participat la toate Jocurile Olimpice de când a redevenit independentă, în 1991. Estonia a obținut cele mai multe medalii la atletism, haltere, lupte și schi fond.