Prima Fitna
Primul război civil din Islam, cunoscut și sub numele de Prima Fitna, a izbucnit în timpul domniei celui de-al patrulea calif Ali și a durat pe toată durata califatului său. Cel de-al treilea calif Uthman ibn Affan fusese asasinat de grupuri musulmane rebele care aveau motive politice. După ce Ali a preluat conducerea, cea mai importantă problemă cu care s-a confruntat a fost aceea de a-i pedepsi pe cei responsabili de crimă. Cu toate acestea, mulți oameni au considerat că, înainte de a accepta poziția de calif, Ali ar fi trebuit să își concentreze atenția asupra găsirii și pedepsirii criminalilor. Un grup de oameni conduși de Aisha, soția lui Mahomed, de cumnații ei Talhah și Zubair ibn al-Awam au refuzat să recunoască califatul lui Ali. În schimb, au ridicat o armată care s-a întâlnit cu armata lui Ali la Basra, în Irak, inițial în scopul negocierilor. În timpul nopții, au izbucnit lupte, probabil din cauza confuziei sau din cauza unor grupuri de rebeli care au fost implicate în infama crimă. Acest lucru a dus la Bătălia de la Bassorah (cunoscută și sub numele de Bătălia de la Cămila), în care partidul lui Ali a ieșit victorios. Aisha a fost escortată onorabil la Medina după bătălie de către Ali.
Totuși, această bătălie nu a pus capăt în totalitate tensiunilor din imperiul musulman. În curând, Ali a fost provocat de Muawiyah, guvernatorul provinciilor musulmane din Siria. Și el a ridicat problema pedepsirii ucigașilor lui Uthman și a refuzat să-l recunoască pe Ali ca calif până când problema nu va fi rezolvată. Muawiyah era o rudă a lui Uthman și armata sa s-a angajat să îi aducă în fața justiției pe ucigași și pe cei care i-au adăpostit. Această referire la oamenii care îi adăpostesc pe ucigași era la adresa lui Ali și a adepților săi. În consecință, cele două grupuri s-au întâlnit și au purtat o bătălie, numită Bătălia de la Siffin. Această bătălie s-a încheiat la egalitate, astfel că ambele grupuri au decis să recurgă la arbitraj, care, de asemenea, nu a dus la nicio decizie concretă. Între timp, un alt grup de musulmani, kharijiiții, care fuseseră anterior alături de Ali, l-au respins, deoarece considerau că acesta nu urma adevăratul islam și că își conducea afacerile asupra califatului ca și cum acesta ar fi fost proprietatea sa.
În anii care au urmat, guvernatorii lui Ali nu au putut împiedica pierderea provinciilor de către Muawiyah, care și-a sporit puterea prin extinderea armatei sale. Ali a mutat capitala califatului de la Medina la Kufa în 656. A fost ucis de un asasin kharijit în Kufa în 661.