Casa de Braganza a fost fondată în 1442. Acesta este momentul în care Afonso, al optulea conte de Barcelos, a fost numit duce de Braganza. Alfonso (Alfonso I) a fost un fiu nelegitim al regelui João I al Portugaliei, din Casa de Aviz. A fost făcut duce de către nepotul său, regele Afonso al V-lea al Portugaliei. Ducii feudali au adunat rapid o avere în proprietăți, titluri și putere. Până la mijlocul anilor 1600, Casa era cea mai puternică din întreaga Portugalie. Era, de asemenea, una dintre cele mai mari case din Iberia.
Casa de Braganza a devenit prima casă domnitoare a Braziliei, odată cu crearea Regatului Unit al Portugaliei, Braziliei și Algarves, în 1815. Regatul Unit a durat până în 1822, când Imperiul brazilian a devenit independent de Portugalia. Noua națiune braziliană a fost condusă de Prințul Pedro de Braganza, moștenitorul tronului portughez, care a domnit ca Împăratul Pedro I al Braziliei, precum și ca Regele Pedro al IV-lea al Portugaliei. Până în 1835, Braganza portughezi au fost încă în linia de succesiune la tronul brazilian. Casa a fost deposedată (înlăturată) de tronul brazilian, în 1889, când Brazilia a fost proclamată republică.
Casa a continuat să fie casa pretendentă la tronul brazilian până în 1921. Atunci a murit Isabel, Prințesa Imperială a Braziliei, fiica Împăratului Pedro al II-lea al Braziliei. Pretenția ei a trecut la fiul ei, Prințul Pedro Henrique de Orléans și Braganza. Astfel, Casa de Orléans-Braganza a devenit casa revendicatoare la fosta monarhie a Braziliei. Pedro Henrique a murit în 1981. Actualul pretendent este fiul său cel mare, Prințul Luiz.
În Portugalia, regele Carlos I al Portugaliei a fost asasinat în 1908. În atac a fost ucis și fiul său cel mare. Fiul său mai tânăr, Manuel al II-lea, a devenit rege. Când a fost înființată Republica Portugheză, în 1910, regele Manuel al II-lea și restul familiei Braganza au plecat în exil.