Archamoebae sunt un grup important de amibe. Acestea sunt neobișnuite în rândul protiștilor, deoarece nu au mitocondrii.
Grupul include multe genuri care sunt paraziți interni sau comensali ai animalelor: de exemplu, Entamoeba și Endolimax. Unele sunt agenți patogeni umani, provocând boli precum dizenteria amibiană. Alte genuri de archamoebae trăiesc în habitate de apă dulce și au flageli. Majoritatea au un singur nucleu și un singur flagel, dar amiba gigantică Pelomyxa are mai multe din fiecare.
Analiza a 100 de gene arată că Archamoebae face parte din grupul Amoebozoa, care și-a pierdut mitocondriile. Ele sunt rude apropiate cu mucegaiurile de noroi. Formele parazite și comensale, precum Entamoeba și Endolimax, s-au dezvoltat separat de strămoșii cu viață liberă.