Pittsburgh Pirates a fost înființată în 1882. Prima dată au jucat peste râu de centrul orașului Pittsburgh, într-o zonă care pe atunci era un oraș separat, numit Allegheny. Echipa se mai numea Allegheny sau "the Alleghenys". În jurul anului 1890, orașul Pittsburgh a anexat Allegheny. Echipa a fost atunci redenumită "Pittsburgh", fără a avea încă o poreclă.
În 1891, echipa din Pittsburgh a semnat un contract cu un jucător care aparținuse unei echipe din altă ligă. Au fost acuzați că au "piratat" contractul jucătorului. La scurt timp după aceea, fanii au început să numească echipa "Pirații". Mai târziu, echipa a adoptat acest nume ca denumire oficială a echipei, Pittsburgh Pirates.
Pirates au câștigat cinci World Series. Prima oară au câștigat-o în 1909, învingându-i pe cei de la Detroit Tigers. Pirates a mai câștigat titluri World Series în 1925, 1960, 1971 și 1979.
Printre jucătorii celebri ai echipei Pirates se numără Honus Wagner, Ralph Kiner, Roberto Clemente și Willie Stargell.