Primele națiuni din Canada au trăit mult timp pe Point Pelee. Acest lucru s-a întâmplat înainte ca europenii să vină să colonizeze zona. Oamenii cred că oamenii locuiau pe cel mai mare sit arheologic care a fost descoperit la Point Pelee între anii 700 și 900 d.Hr. Punctul Pelee a fost numit de doi preoți în 1670. Aceștia erau părinții Dollier și Galinee. Cuvântul pelée este cuvântul francez pentru chelie.
Naturaliștii și vânătorii au dorit să protejeze zona. Aceștia au considerat că biodiversitatea virșilor trebuie protejată de dezvoltarea terenurilor din zonă. Înainte ca parcul să fie creat, a fost creat un grup numit Societatea Ornitologică a Marilor Lacuri. Aceștia au studiat migrația păsărilor din zonă. În 1915, aceștia au recomandat ca Point Pelee să devină parc național. Acesta a fost primul parc național care a fost creat pentru a proteja zona. Acest lucru a schimbat modul în care au fost create parcurile naționale. Când a fost creat parcul, în zonă existau încă multe cabane și două hoteluri. Existau, de asemenea, multe ferme și o școală.
Multe căsuțe erau încă în construcție după ce a fost creat parcul național. După prăbușirea Wall Street din 1929, nu a mai fost vândut niciun teren din parc. Parcul a avut un plan de dezvoltare în anii 1920. O autostradă ar fi trebuit să fie construită în parc. Începând cu anii 1960, o mulțime de oameni au mers în parc. Point Pelee a devenit parcul național în care au mers cei mai mulți oameni. Aproape 781 000 de persoane au mers la Point Pelee în 1963. Pentru că mulți oameni au vizitat parcul, o mare parte din natură și din viața sălbatică a fost distrusă. Din acest motiv, guvernul Canadei a declarat că Point Pelee nu ar mai trebui să fie un parc național.
După anii 1980, guvernul Canadei a început să protejeze mai mult această zonă. Nu au mai permis mașinilor să ajungă până la vârf. În schimb, au început să pună în funcțiune o navetă către vârf. Au început să cumpere toate căsuțele din parc și să le îndepărteze. Au îndepărtat peste 350 de clădiri. De asemenea, au eliminat două drumuri. În 1989, vânătoarea de rațe nu a mai fost permisă în parc. În 1991, guvernul a început să ucidă o parte din cerbii din parc pentru a proteja plantele. După aceea, au mai omorât o parte dintre căprioare de câteva ori.
Point Pelee a devenit o rezervație de cer întunecat în 2006. Acesta a fost primul parc național din Canada care a devenit rezervație de cer întunecat. În 2006, valurile lacului Erie au luat la vale vârful. După aceea, în 2007, vârful a reapărut. Acest lucru s-a datorat faptului că nivelul apei din Lacul Erie a scăzut. Vârful se modifică în fiecare an, devenind mai lung sau mai scurt. În 2017, un incendiu în Point Pelee a ars o parte din terenul mlăștinos. Au ars aproximativ 125 de hectare.
