Terenul din jurul lacului este casa tribului Thao. Acesta este un popor aborigen. Potrivit legendei, vânătorii Thao au descoperit Lacul Sun Moon după ce au urmărit o căprioară. Căprioara i-a condus la lac. Ei au descoperit că lacul era frumos și avea o mulțime de pești. O insulă din mijlocul lacului este considerată a fi locul de închinare pentru poporul Thao.
În trecut, lacul se numea Lacul Candidius. A fost numit după misionarul Georgius Candidius. Lacul a fost numit pentru prima dată Lacul Lunii Soarelui în 1821, într-o carte intitulată Travels to Shueilishe de Deng Chuan-an. În timpul dinastiei Qing, chinezii au început să se mute în zona din jurul Lacului Sun Moon. Mulți oameni au vrut să deschidă restaurante, hoteluri și magazine acolo.
Când Taiwanul a fost condus de Japonia, aceasta a făcut multe schimbări. Primele centrale electrice au fost construite în 1934. Construcția a durat 15 ani, iar proiectul a început în 1919. Calea ferată Jiji Line a fost construită pentru a ajuta la construcția centralelor electrice. Insula Lalu a fost redenumită "Insula Jade". Japonezii au construit un baraj mare în 1931 care a făcut ca lacul să fie mult mai mare. În 1946, noul guvern chinez a redenumit lacul "Insula Kuanghua". Numele a rămas așa până la cutremurul 921 din 1999, care a avariat insula. După cutremur, insula a fost redenumită Insula Lalu. A fost redenumită deoarece guvernul taiwanez a dorit să ajute la conservarea culturii Thao.
În 1967, a fost creat un centru cultural aborigen pentru a ajuta la conservarea culturii Thao. În 1975, centrul a fost deschis. În 1990, un iaht s-a întors cu susul în jos în timp ce se afla în apă. Acesta a provocat moartea a 57 de persoane. Doar 25 de persoane au supraviețuit. În 2012, o imagine a Lacului Sun Moon a fost folosită în pașapoartele Republicii Populare Chineze. Acest lucru a provocat furia guvernului taiwanez, care susține că Taiwanul și Lacul Sun Moon nu fac parte din Republica Populară Chineză.