O închidere a apărării împotriva inundațiilor din cadrul barierei Tamisei este declanșată atunci când sunt prognozate maree mari în Marea Nordului și când debitele fluviale sunt mari la limita mareelor la barajul Teddington. În cazul în care nivelul apei ar putea depăși 4,87 metri în centrul Londrei, acesta este momentul declanșării.
Închiderea începe cu aproximativ 9 ore înainte ca mareea înaltă periculoasă să ajungă la barieră. Mesajele dau ordin să se oprească traficul pe râu, să se închidă porțile subsidiare și să se alerteze ceilalți utilizatori ai râului. Pe lângă bariera Tamisei, trebuie închise și porțile mai mici de-a lungul Thames Tideway. Odată ce navigația fluvială a fost oprită și toate porțile au fost închise, atunci poate fi închisă însăși bariera Tamisei. Mai întâi se închid porțile mai mici, apoi se închid succesiv principalele deschideri navigabile. Porțile rămân închise până când mareea din aval de barieră scade la același nivel cu nivelul apei din amonte.
După ploi abundente la vest de Londra, apele curg pe Tamisa în amonte (înainte de Londra). Deoarece fluviul are maree de la barajul Teddington până la Londra, această problemă apare doar la maree înaltă, ceea ce împiedică apele de inundație să iasă în mare. De la Teddington, râul se deschide în estuarul său, iar la mareea joasă poate prelua debite mult mai mari cu cât se merge mai mult în aval.
Atunci când râul este în amonte, dacă porțile sunt închise la scurt timp după fluxul scăzut, în spatele barierei se află un volum imens de apă goală care poate acționa ca un rezervor pentru a reține apele care trec peste barajul Teddington. Cele mai multe inundații ale râului nu vor umple acest volum în cele câteva ore de maree înaltă în care bariera trebuie închisă. Dacă bariera nu ar exista, mareea înaltă ar umple în schimb acest volum, iar apele ar putea să se reverse peste malurile râurilor din Londra. Aproximativ o treime din închiderile de până în 2009 au fost efectuate pentru a preveni inundațiile cauzate de ploile abundente din vestul Londrei.