Shinya Yamanaka (născut la 4 septembrie 1962 în Osaka) este un medic japonez. A primit Premiul Nobel pentru Fiziologie sau Medicină pentru 2012 împreună cu John Gurdon. A primit Premiul Wolf pentru Medicină în 2011 împreună cu Rudolf Jaenisch; și Premiul pentru Tehnologie al Mileniului în 2012 împreună cu Linus Torvalds.

El face cercetări în domeniul celulelor stem adulte. Este director al Centrului de cercetare și aplicare a celulelor iPS și profesor la Institutul pentru Științe Medicale de Frontieră de la Universitatea din Kyoto. Este, de asemenea, cercetător principal la J. David Gladstone Institutes, afiliat la UCSF, din San Francisco, California; și profesor de anatomie la Universitatea din California, San Francisco (UCSF). Yamanaka este, de asemenea, actualul președinte al Societății Internaționale pentru Cercetarea Celulelor Stem (ISSCR).