Dakota au trăit în Wisconsin și Minnesota în secolul al XVII-lea. Până în anul 1700, unii s-au mutat în Dakota de Sud de astăzi. La sfârșitul secolului al XVII-lea, Dakota s-au aliat cu negustorii francezi. Francezii au încercat să folosească această alianță pentru a-i ajuta să controleze comerțul cu blănuri din America de Nord împotriva englezilor.
Războiul Dakota din 1862
La sfârșitul anilor 1850, încălcările tratatului de către Statele Unite și plățile nedrepte ale agenților indieni (persoane guvernamentale cărora li se permitea să interacționeze cu indigenii) au dus la creșterea foametei și a greutăților în rândul populației Dakota. Chiar dacă Dakota a încercat să negocieze cu guvernul american, nimic nu a avut succes. La 16 august 1862, un grup de vânători Dakota a ucis o familie de coloniști. Acest lucru a dus la mai multe atacuri asupra coloniștilor și, în curând, a început un război total. La 5 noiembrie 1862, 38 de războinici Dakota au fost condamnați la moarte prin spânzurare. Aceasta avea să devină mai târziu cea mai mare execuție în masă din istoria Statelor Unite.
În timpul și după revoltă, mulți Dakota de Est și familiile lor au părăsit Minnesota și Dakota de Est pentru a merge în Canada sau pentru a se stabili în Valea râului James într-o rezervație de scurtă durată. Apoi au fost forțați să se mute în rezervația Crow Creek de pe malul estic al râului Missouri. Unii s-au alăturat celor din Dakota de Vest și s-au mutat mai la vest pentru a ajuta triburile Lakota să continue lupta împotriva armatei americane.
Alții au rămas în Minnesota și în est, în mici rezervații care încă există, inclusiv în rezervațiile Sisseton-Wahpeton, Flandreau și Devils Lake (Spirit Lake sau Fort Totten) din Dakota. Unii s-au mutat în Nebraska, unde tribul Santee Sioux are astăzi o rezervație pe malul sudic al râului Missouri.
Cei care au fugit în Canada au lăsat nouă mici rezervații pentru familiile lor în Manitoba (Sioux Valley, Long Plain, Dakota Tipi, Birdtail Creek și Oak Lake [Pipestone]) și alte patru (Standing Buffalo, Moose Woods [White Cap], Round Plain [Wahpeton] și Wood Mountain) în Saskatchewan.