Khoisan este numele a două popoare din Africa de Sud: San și Khoikhoi. San sunt oameni care se hrănesc cu hrană, iar Khoi sunt un popor pastoral cunoscut anterior sub numele de Hotentots. Relația dintre cele două grupuri nu este foarte clară. San sunt în general mai mici decât ceilalți oameni din zonă. De asemenea, ei arată foarte diferit față de alte grupuri de oameni din zonă. În 2018, au mai rămas între 90.000 și 100.000 de San. Cei mai mulți dintre ei trăiesc în Botswana și Namibia. Există minorități San în Africa de Sud, Angola, Zambia și Zimbabwe.
San au fost unii dintre primii locuitori (indigeni) ai Africii de Sud. Apoi, migrațiile Bantu din Africa de Nord și de Est spre sud au ajuns în regiune acum 700 de ani. Populațiile bantu i-au înlocuit pe Khoi și San și au devenit locuitorii predominanți ai Africii de Sud.
Khoisan "a fost cea mai mare populație de pe Pământ la un moment dat", potrivit unui genetician evoluționist. Dovada prezenței inițiale a khoisanilor în Africa de Sud este distribuția limbilor lor în prezent. Grupurile de limbi khoisan prezintă adesea diferențe extreme de structură și vocabular, în ciuda apropierii apropiate, ceea ce demonstrează o perioadă lungă de colonizare și co-evoluție a limbilor în aceeași regiune.
Charles Darwin a scris despre Khoisan și despre selecția sexuală în lucrarea "Descendența omului" din 1882, comentând că steatopigia lor a evoluat prin selecție sexuală în evoluția umană și că "partea posterioară a corpului se proiectează în cel mai minunat mod".
În anii 1990, studiile genomice ale popoarelor lumii au descoperit că cromozomul Y al bărbaților San prezintă modele de polimorfisme diferite de cele ale tuturor celorlalte populații. Deoarece cromozomul Y se modifică puțin, acest tip de test ADN este folosit pentru a determina momentul în care diferite subgrupuri umane s-au separat unele de altele. Acest lucru arată ultimul lor strămoș comun. Autorii acestor studii sugerează că este posibil ca San să fi fost una dintre primele populații care s-au diferențiat de cel mai recent strămoș comun al tuturor oamenilor vii, care se estimează că a trăit acum 60.000-90.000 de ani.
