Botanică
Stopes a publicat aproximativ 100 de lucrări și cărți despre botanică, majoritatea despre plante fosile. A fost expertă în ferigi fosile, cicade și gimnosperme.
Între 1904 și 1907, a fost lector în paleobotanică la Universitatea din Manchester; a fost prima femeie academică din cadrul acestei universități.p12 În 1910, la vârsta de 30 de ani, a devenit membră a University College London. Ajunsese în vârful copacului. Nu numai că era paleobotanistă, dar era și expertă în botanica măsurilor de cărbune care au fost depuse în Pennsylvaniei (Carboniferul superior). Cărbunele era cea mai vitală sursă de energie la acea vreme.
Stopes a continuat să publice articole despre botanică până în 1935, dar, în jurul anului 1912, interesele sale au început să se schimbe din cauza problemelor din viața privată.
Controlul nașterilor și sănătatea femeilor
După o căsnicie dezastruoasă, Stopes a devenit conștientă de cât de ignoranți erau mulți oameni în ceea ce privește sexul și de problemele pe care le aveau femeile în cadrul căsătoriei. Obiectivele sale erau: îmbunătățirea fericirii prin îmbunătățirea cunoștințelor și protejarea sănătății femeilor prin controlul sarcinilor care apar în mod natural în timpul căsătoriei.
Prima carte a lui Stopes despre planificarea familială, Married Love: a new contribution to the solution of the sex difficulties (Dragoste conjugală: o nouă contribuție la rezolvarea problemelor sexuale), 1918, a avut 28 de ediții și peste 150 de retipăriri. A fost tradusă în 14 limbi și în braille. Versiunea în limba engleză s-a vândut în peste un milion de exemplare și a făcut-o bogată.
Efectele sociale ale cărții au fost extraordinare. Nimeni nu poate spune de ce au loc schimbări sociale, însă atitudinile față de sex și căsătorie s-au schimbat cu siguranță în timpul vieții ei. Între prima ediție a cărții sale și ultima, femeile din Europa și America de Nord au trecut de la o situație în care aproape că nu aveau control al nașterilor la cea în care majoritatea foloseau acest tip de control. Acest lucru s-a întâmplat în ciuda opoziției Bisericii Catolice și a altor forțe.
De asemenea, a existat o îmbunătățire continuă a cunoștințelor despre sex și a atenției medicale acordate nevoilor femeilor în ceea ce privește nașterea. Disponibilitatea cunoștințelor despre toate subiectele legate de viața personală a continuat să se îmbunătățească.
Mai târziu, în 1918, Stopes a publicat o a doua carte, Wise Parenthood: a sequel. Aceasta a ajuns la 25 de ediții și multe retipăriri. în 1919 a apărut O scrisoare către mamele care muncesc despre cum să aibă copii sănătoși și să evite sarcinile care slăbesc. Fluxul de cărți și broșuri a continuat până la sfârșitul vieții ei.
Clinica Marie Stopes
Stopes a deschis prima clinică de planificare familială din Marea Britanie la 17 martie 1921, pe strada Marlborough Road nr. 61, Holloway, în nordul Londrei. În 1925, Clinica pentru mame s-a mutat în centrul Londrei, unde a rămas până în prezent.
Organismul mamă al clinicilor Marie Stopes din întreaga lume se numește acum Marie Stopes International. Aceasta este deosebit de puternică în Bangladesh și Pakistan.