L'Enfant s-a referit la dealul ales ca locație a viitoarei Case a Congresului ca fiind "Jenkins Hill" sau "Jenkins Heights". Cu toate acestea, terenul a aparținut timp de mulți ani familiei Carroll și a fost notat în registrele de proprietate ale acesteia ca fiind "New Troy". Unii oameni au spus că un bărbat pe nume Jenkins ar fi pășunat cândva niște animale pe locul unde se află Capitoliul (și, astfel, numele său a fost asociat cu locul), artistul John Trumbull, care avea să picteze mai multe picturi murale în interiorul rotondei Capitoliului, a raportat în 1791 că locul era acoperit de un lemn gros, ceea ce îl făcea un loc puțin probabil pentru ca animalele să pască. Nimeni nu știe cine a fost Jenkins și cum a ajuns numele său să fie asociat cu dealul, așa cum a raportat L'Enfant.
Cartierul care se numește acum Capitol Hill a început să se dezvolte atunci când guvernul a început să lucreze la două locații, Capitoliul și Washington Navy Yard. A devenit o comunitate distinctă între 1799 și 1810, pe măsură ce guvernul federal a devenit un angajator important. Prima etapă a istoriei sale timpurii a fost cea a unei comunități de pensiuni dezvoltate pentru membrii Congresului. În primii ani ai Republicii, puțini congresmeni au dorit să își stabilească reședința permanentă în oraș. În schimb, cei mai mulți au preferat să locuiască în pensiuni aflate la distanță de mers pe jos de Capitoliu.
În 1799, pe malul râului Anacostia a fost înființat șantierul naval din Washington, care a oferit locuri de muncă pentru meșteșugarii care construiau și reparau nave. Mulți dintre meșterii care au fost angajați atât la Navy Yard, cât și la construcția Capitoliului au ales să locuiască la distanță de mers pe jos, la est de Capitoliu și la nord de Navy Yard. Aceștia au devenit populația rezidențială inițială a cartierului. În 1806, președintele Thomas Jefferson a ales locația cazărmii Marine Barracks, care trebuia să se afle la distanță de mers atât de Capitoliu, cât și de Casa Albă, nu departe de Washington Navy Yard. Până în 1810, în zonă înfloreau magazine, auriști, fierari și biserici.
Războiul Civil a dus la creșterea numărului de clădiri în zona Capitol Hill, inclusiv la construirea de noi spitale. Construcția de noi case a continuat în anii 1870 și 1880. Cartierul a început să se divizeze pe criterii rasiale și de clasă economică.
Electricitatea, apa curentă și instalațiile sanitare au fost introduse în anii 1890 și au fost disponibile pentru prima dată în zonele centrale ale Districtului Columbia, inclusiv în Capitol Hill. Între 1890 și 1910 a avut loc un boom al dezvoltării imobiliare, zona Capitol Hill devenind unul dintre primele cartiere care dispuneau de aceste facilități moderne.
În 1976, Serviciul Parcurilor Naționale a adăugat districtul istoric Capitol Hill la Registrul Național al Locurilor Istorice. Acesta este unul dintre cele mai mari districte istorice din Statele Unite. Limitele districtului istoric sunt neregulate, extinzându-se spre sud de la F Street NE, până la est de 14th Street, până la vest de South Capitol Street și cu o limită sudică marcată în principal de Virginia Avenue, dar incluzând un teritoriu până la sud de M Street SE. Acesta include clădiri din perioada federală (1800-1820) până în 1919, dar majoritatea clădirilor sunt din epoca victoriană târzie.
Capitol Hill a rămas un cartier destul de stabil al clasei de mijloc de-a lungul existenței sale. A suferit o perioadă de declin economic și de creștere a criminalității la mijlocul secolului al XX-lea, dar și-a revenit treptat. În timpul așa-numitei "epidemii de crack" din anii 1980, marginile sale au fost adesea afectate. Mai recent, cartierul a cunoscut o intensă îmbogățire.