Ceea ce este acum Sudanul de Sud a făcut parte din Sudanul anglo-egiptean. Această parte a Imperiului Britanic a devenit Republica Sudan când s-a obținut independența în 1956. După primul război civil sudanez, în 1972 a fost formată Regiunea Autonomă Sudanul de Sud, care a durat până în 1983. Un al doilea război civil sudanez s-a dezvoltat curând și s-a încheiat cu Acordul global de pace din 2005. Mai târziu, în același an, a fost format Guvernul Autonom al Sudanului de Sud. Sudanul de Sud a devenit stat independent la 9 iulie 2011, la miezul nopții, ora locală, în urma unui referendum organizat în ianuarie 2011. În cadrul referendumului, aproape 99% dintre alegători au dorit să se separe de restul Sudanului.
Consiliul de Securitate al Organizației Națiunilor Unite s-a reunit la 13 iulie 2011 pentru a discuta în mod oficial aderarea Republicii Sudanului de Sud. A doua zi, la 14 iulie 2011, Sudanul de Sud a devenit stat membru al Organizației Națiunilor Unite. Sudanul de Sud a solicitat, de asemenea, să adere la Commonwealth of Nations, la Comunitatea Africii de Est, la Autoritatea Interguvernamentală pentru Dezvoltare, la Fondul Monetar Internațional și la Banca Mondială. Țara a fost declarată eligibilă pentru a solicita, de asemenea, să devină membră a Ligii Arabe.
La Jocurile Olimpice de vară din 2012, un atlet din Sudanul de Sud a concurat sub drapelul Comitetului Internațional Olimpic. În 2013 a izbucnit un război civil.