Tool a început în 1991, când Keenan și chitaristul Jones au început să exerseze împreună. Tom Morello le-a făcut cunoștință cu toboșarul Danny Carey, care locuia în clădirea în care exersau, iar acesta s-a alăturat curând și el. Basistul Paul D'Amour a fost ultimul care s-a alăturat trupei. D'Amour a părăsit formația în 1995 pentru a lucra cu alte trupe. Justin Chancellor a fost angajat pentru a-l înlocui.
Opiacee
Tool a realizat primul său album în 1992. Acesta s-a numit Opiate EP. Pentru a-i ajuta să vândă discuri, au plecat în turneu. Au călătorit în jurul Statelor Unite, cântând în concerte cu alte două trupe numite Fishbone și Rage Against the Machine. În timpul unuia dintre concertele lor din 1993, trupa a cântat la Centrul de celebrități al Bisericii Scientologice din Los Angeles. Keenan (care avea să scrie mai târziu versurile "Fuck L. Ron Hubbard and fuck all his clones"), a bătut ca o oaie o mare parte din spectacol.
Rezultate
La început, albumul nu s-a vândut în multe exemplare. După ce Tool a devenit mai popular, mai mulți fani au cumpărat Opiate. A fost nevoie de 13 ani pentru ca albumul să fie certificat de platină de către RIAA. Asta înseamnă că albumul s-a vândut în un milion de exemplare.
Undertow
Primul album de studio al trupei Tool a apărut în 1993. Se numea Undertow. În 1994, trupa a lansat un cântec, intitulat "Prison Sex", extras de pe album. Alături de acesta a fost un videoclip creat și regizat de Jones. Videoclipul a fost considerat "prea grafic și ofensator" și a fost difuzat doar de câteva ori pe MTV, deoarece videoclipul tratează abuzul asupra copiilor.
Rezultate
Albumul a ajuns pe locul 50 în Billboard 200 și pe locul 1 în Top Heatseekers. A fost certificat cu aur de către RIAA după numai opt luni și cu platină mai puțin de un an mai târziu.
Ænima
În octombrie 1996, trupa a lansat cel de-al doilea album de studio, intitulat Ænima. Tool a început o lungă luptă juridică cu casa lor de discuri Volcano Records (fosta Zoo Records) din cauza unor probleme cu contractul lor. Au sfârșit prin a încheia un nou contract care prevedea că vor mai face încă trei albume. Membrii trupei Tool au decis să ia o pauză după aceea.
Rezultate
Albumul a fost certificat aur în 10 săptămâni și a obținut dublă platină, ceea ce înseamnă că a vândut două milioane de exemplare, în 10 luni. În 1998, "Ænema" a câștigat premiul Grammy pentru cea mai bună interpretare metal.
Inoculul de frică
26 ianuarie 2020, Tool a câștigat premiul Best Metal Performance la cea de-a 62-a ediție a premiilor GRAMMY pentru ("7empest.") Membrii trupei Justin Chancellor și Danny Carey au fost prezenți pentru a accepta premiul.