După o copilărie oarecum tulbure, Anna a fost psihanalizată de tatăl ei. Când analiza sa a fost finalizată în 1922, a devenit ea însăși psihanalist. A predat la Institutul de formare psihanalitică din Viena tehnica analizei copilului. Din 1925 până în 1934, a fost secretară a Asociației Psihanalitice Internaționale. Ea a continuat analiza copilului și a organizat seminarii și conferințe pe această temă.
După Anschluss-ul din 1938, familia Freud a fugit din Viena și a venit la Londra. Freud însuși era pe moarte din cauza cancerului, așa că Anna s-a ocupat de gospodărie. Anna a avut un dezacord profesional cu Melanie Klein, care venise la Londra mult mai devreme și care era deja stabilită ca psiholog pentru copii. O serie de "discuții controversate" au fost organizate de Societatea Psihanalitică Britanică. Discuțiile se refereau la formarea și ideile ambelor părți. În cele din urmă s-a ajuns la un acord ca ambele "școli" să coexiste în cadrul Societății. În prezent, Societatea are trei divizii de formare: Kleinian, Freudian și Independent.
În timpul războiului, Freud a studiat efectul privării de îngrijire parentală asupra copiilor. A înființat un centru pentru tinerele victime ale războiului, numit "Hampstead War Nursery". Aici copiii au primit îngrijire adoptivă, iar mamele au fost încurajate să îi viziteze cât mai des posibil.
În 1947, Freud și Kate Friedlaender au înființat Hampstead Child Therapy Courses. Cinci ani mai târziu, a fost adăugată o clinică pentru copii. Freud a început să țină prelegeri despre psihologia copilului.
Din anii 1950 până la sfârșitul vieții, Freud a călătorit în mod regulat în Statele Unite pentru a ține prelegeri, a preda și a-și vizita prietenii. În anii 1970, a fost preocupată de problemele copiilor defavorizați din punct de vedere emoțional și social. La Facultatea de Drept din Yale, a predat seminarii despre criminalitate și familie.
Freud a murit la Londra, la 9 octombrie 1982. A fost incinerată la Crematoriul Golders Green, iar cenușa i-a fost așezată pe un raft de marmură lângă urna funerară grecească antică a părinților săi. Prietena ei de-o viață Dorothy Burlingham și alți câțiva membri ai familiei Freud se odihnesc, de asemenea, acolo.
