Clorofila este necesară pentru fotosinteză, care permite plantelor să obțină energie din lumină.
Moleculele de clorofilă sunt dispuse în interiorul și în jurul membranelor cloroplastelor. Aceasta îndeplinește două funcții principale. Funcția majorității clorofilei (până la câteva sute de molecule per fotosistem) este de a absorbi lumina și de a transfera energia luminoasă către centrele de reacție. Acești pigmenți sunt denumiți după lungimea de undă (în nanometri) a maximului de absorbție a vârfului lor roșu. Acești pigmenți clorofilieni pot fi separați printr-un simplu experiment de cromatografie pe hârtie.
Funcția centrului de reacție clorofilă este de a utiliza energia transferată de ceilalți pigmenți clorofilieni pentru a efectua o reacție redox specifică. În această reacție, clorofila dă un electron unui lanț de transport al electronilor. Această reacție este modul în care organismele fotosintetice, cum ar fi plantele, produc gaz O2 și este sursa pentru practic tot O2 din atmosfera Pământului. Fotosistemul I funcționează de obicei în serie cu fotosistemul II.
Fluxul de electroni produs de pigmenții clorofilieni din centrul de reacție este utilizat pentru a transporta ionii H+ prin membrană, stabilind un potențial chemiosmotic utilizat în principal pentru a produce energie chimică ATP; iar acei electroni reduc în cele din urmă NADP+ la NADPH, un reductor universal utilizat pentru a reduce CO2 în zaharuri, precum și pentru alte reduceri biosintetice.
S-a descoperit că un melc de mare verde, Elysia chlorotica, folosește clorofila pe care a mâncat-o pentru a face fotosinteză pentru el însuși. Acest proces este cunoscut sub numele de cleptoplastie și nu s-a descoperit niciun alt animal care să aibă această capacitate.
De ce verde și nu negru?
Încă nu este clar de ce anume plantele au evoluat pentru a fi verzi. Plantele verzi reflectă în principal lumina verde și aproape verde, în loc să o absoarbă. Alte părți ale sistemului de fotosinteză permit totuși plantelor verzi să utilizeze spectrul de lumină verde (de exemplu, prin structura frunzelor care captează lumina, prin carotenoizi etc.). Plantele verzi nu utilizează o mare parte din spectrul vizibil cât mai eficient posibil. O plantă neagră poate absorbi mai multe radiații, iar acest lucru ar putea fi foarte util, fără a ține cont de problemele legate de eliminarea acestei călduri suplimentare (de exemplu, unele plante trebuie să își închidă deschiderile, numite stoma, în zilele călduroase pentru a evita să piardă prea multă apă). Mai exact, întrebarea devine de ce singura moleculă care absoarbe lumina și care este folosită pentru energie în plante este verde și nu pur și simplu neagră.
Biologul John Berman a afirmat că evoluția nu este un proces de inginerie, astfel că are adesea limite pe care un inginer sau un alt proiectant nu le are. Chiar dacă frunzele negre ar fi mai bune, limitele evoluției pot împiedica speciile să devină cât mai eficiente posibil. Berman a scris că obținerea unor pigmenți care să funcționeze mai bine decât clorofila ar putea fi foarte dificilă. De fapt, se crede că toate plantele superioare (embriofite) au evoluat de la un strămoș comun care este un fel de algă verde - astfel încât clorofila a evoluat o singură dată (strămoș comun).
Shil DasSarma, genetician microbian de la Universitatea din Maryland, a subliniat că speciile de archaea folosesc o altă moleculă care absoarbe lumina, retinal, pentru a obține energie din spectrul verde. Unii oameni de știință cred că arheele care absorb lumina verde au fost cândva cele mai răspândite în mediul terestru. Acest lucru ar fi putut lăsa deschisă o "nișă" pentru organismele verzi care să absoarbă celelalte lungimi de undă ale luminii solare. Aceasta este doar o posibilitate, iar Berman a scris că oamenii de știință nu sunt încă convinși de nicio explicație.