Un haplotip este un termen din genetică. Este prescurtarea de la genotip haploid. Un haplotip este o colecție de alele specifice (anumite secvențe de ADN) dintr-un grup de gene strâns legate între ele pe un cromozom. Un grup este de obicei moștenit împreună. Simplificând, haplotipul este un grup strâns legat de gene pe care un copil îl moștenește de la unul dintre părinți.

O a doua semnificație a termenului haplotip este un set de polimorfisme de un singur nucleotid (SNP) care se găsesc de obicei împreună pe o singură cromatidă (dintr-o pereche de cromozomi). Astfel, găsirea câtorva alele dintr-o secvență haplotipică identifică toate celelalte situri din regiunea sa. Astfel de informații sunt foarte valoroase pentru investigarea geneticii bolilor comune.

Compararea haplotipurilor a două sau mai multe persoane arată gradul de rudenie genetică dintre liniile lor respective. Aceasta se realizează în cadrul proiectelor de genealogie genetică.