Un enterotip este o clasificare a florei intestinale. Aceasta se bazează pe ecosistemul din sistemul intestinal uman. Clasificarea se face prin identificarea bacteriilor și a protiștilor care trăiesc acolo. Acesta se numește "biomul intestinal uman".
Cercetările arată că există trei ecosisteme distincte în intestinele oamenilor. Oamenii pot fi clasificați într-unul dintre cele trei grupuri pe baza bacteriilor din intestinele lor. Enterotipul fiecărei persoane este stabilit în timp ce persoana este un copil.
Enterotipul afectează modul în care o persoană poate digera alimentele sau absorbi medicamentele. Cimpanzeii au enterotipuri care arată similar cu enterotipurile umane.
Tipul 1 are niveluri ridicate de Bacteroides. Prevotella sunt frecvente în tipul 2. Tipul 3 are niveluri ridicate de Ruminococcus.