Secvențele de ADN necodificatoare sunt acele părți din ADN-ul unui organism care nu codifică secvențe de proteine.
O parte din ADN necodificator este transcrisă în molecule de ARN necodificator funcționale (de exemplu, ARN de transfer, ARN ribozomal și ARN reglator), în timp ce altele nu sunt transcrise sau dau naștere la transcripte de ARN cu funcție necunoscută. Cantitatea de ADN necodificator variază foarte mult între specii. De exemplu, peste 98% din genomul uman este ADN necodificator, în timp ce doar aproximativ 2% dintr-un genom bacterian tipic este ADN necodificator.
Inițial, o mare parte din ADN necodificator nu avea o funcție biologică cunoscută. A fost cunoscută sub numele de "junk DNA", în special în presă. Cu toate acestea, se știe de ani de zile că multe secvențe necodificatoare sunt funcționale. Printre acestea se numără genele pentru moleculele funcționale de ARN și secvențe de ADN, cum ar fi semnalele de "început de replicare", centromerii și telomerii.
Alte secvențe necodificatoare au funcții probabile, dar încă nedescoperite. Acest lucru este dedus din nivelurile ridicate de similaritate a secvențelor observate în diferite specii de ADN.
Proiectul Enciclopedia elementelor ADN (ENCODE) a sugerat în septembrie 2012 că peste 80% din ADN-ul din genomul uman "are un anumit scop, din punct de vedere biochimic". Această concluzie a fost puternic criticată de alți oameni de știință.

