Monoposturi
În 1986, Formula 3000 a fost introdusă în Japonia. Mugen s-a asociat cu Honda pentru a construi un motor F3000. Acesta a fost introdus în sezonul 1987 și a fost închiriat la 14 echipe. În 1988, Mugen a câștigat patru din primele cinci locuri în campionatul japonez F3000. În 1989, Mugen a intrat în F3000 european cu motorul MF308. Au câștigat campionatul cu Jean Alesi la volanul unui Reynard. În același an, compania a produs propriul prototip de motor V8 de 3,5 L de Formula 1, cu numele de cod MF350.
În 1988, Mugen a început să tuneze motoare Honda pentru a le folosi în Formula 3. Au câștigat seria japoneză cu Akihiko Nakaya, iar în 1990 s-au extins în Europa. Mugen a câștigat primele sale campionate de Formula 3 în Europa. Au cucerit titlul francez cu Eric Hélary și coroana britanică cu Mika Häkkinen. De asemenea, au câștigat titlul în 1991 cu Rubens Barrichello.
Formula 1
În 1991, Mugen a construit motoare Honda V10 pentru Tyrrell. În 1992, motorul a fost redenumit Mugen MF351H. Motorul a fost folosit de echipa Footwork în 1992 și 1993.
În 1994, Mugen s-a mutat la Team Lotus cu noul Lotus 109. Echipa era subfinanțată, iar șasiul 109 a întârziat să sosească. Mașina și motorul acesteia au fost punctate cu un singur punct. La sfârșitul anului, Lotus s-a închis.
Mugen a trecut la echipa Ligier în 1995. În 1996, Mugen a câștigat prima sa cursă de Formula 1. Motorul de 3,0 L, cu numele de cod MF301H, s-a impus în Marele Premiu de la Monaco din 1996, cu Olivier Panis la volan.
Ligier a fost preluată de Alain Prost în 1997 și redenumită Prost Grand Prix. Când Prost a schimbat motoarele Peugeot în 1998, Mugen a ajuns la un acord pe doi ani cu Jordan Grand Prix. În sezonul 1998 a avut loc un rezultat de 1-2 la Spa-Francorchamps cu Damon Hill și Ralf Schumacher.
În 1999, Heinz-Harald Frentzen a câștigat de două ori, iar Jorden a terminat campionatul constructorilor pe locul trei. În 2000, Honda Motor Company a anunțat că va reveni în Formula 1. Honda urma să furnizeze propriile motoare în 2000 cu British American Racing. La sfârșitul sezonului 2000, Mugen s-a retras din F1.
Curse de mașini sport
În 1998, Mugen a intrat în cursele de mașini sport. Au construit mai multe mașini de curse NSX. În 2000, echipa Mugen/Dome a fost campioană.
În 2001, în JGTC, Mugen NSX a câștigat două curse. În iunie, compania a anunțat un nou V8 de 4,0 L. MF408S a fost construit pentru clasa principală de prototipuri din cadrul cursei 24 de ore de la Le Mans și American Le Mans Series.