Fosilele de tranziție (sau verigile lipsă) sunt rămășițele fosilizate ale unor forme de viață care prezintă caracteristici tipice a două grupuri distincte. Poate fi vorba de o fosilă rară, cum ar fi Archaeopteryx, care prezintă caracteristicile timpurii ale unui grup care mai târziu devine răspândit.
Raritatea formelor de tranziție este interesantă. Aceasta sugerează că noile forme nu sunt încă dominante în ecologia timpului lor, iar populațiile lor sunt relativ mici. Rezultă că fosilele lor ar fi rare. În calcarul Solnhofen, unde a fost găsit Archaeopteryx, există mai multe exemplare de pterozauri din mai multe genuri decât de proto-pasăre. În Jurasic, pterozaurii erau dominanți în aer.
Un număr mare de specii de păsări diferite se găsesc în celebrele depozite chinezești de lagerstatten, cum ar fi biota Jehol. Păsările din Cretacicul inferior sunt în mod clar mai asemănătoare cu păsările, iar caracteristicile pe care le-au dezvoltat le-au permis să invadeze nișe de habitat care fuseseră rezervate pterozaurilor, sau poate că nu fuseseră exploatate deloc anterior.
Declinul pterozaurilor (dacă este prezent) nu pare să aibă legătură cu diversitatea păsărilor. De fapt, cel puțin unele nișe de păsări au fost recuperate de pterozauri chiar înainte de evenimentul KT.
