Transpozonii se găsesc în multe forme de viață. Este posibil ca aceștia să fi apărut independent de mai multe ori sau poate doar o singură dată și apoi să se fi răspândit în alte regnuri prin transfer orizontal de gene.
În timp ce unii transpozoni pot conferi beneficii gazdelor lor, majoritatea sunt considerați paraziți egoiști ai ADN-ului. Din acest punct de vedere, sunt asemănători cu virușii. Diferiți viruși și transpozoni au, de asemenea, trăsături comune în ceea ce privește structura genomului și abilitățile biochimice, ceea ce a dus la speculații conform cărora ar avea un strămoș comun.
Activitatea excesivă a transpozonilor poate distruge un genom, ceea ce este letal. Multe organisme au dezvoltat mecanisme pentru a le inhiba. Bacteriile pot folosi ștergerea genelor pentru a elimina transpozonii și virușii din genomul lor, în timp ce organismele eucariote folosesc interferența ARN (RNAi) pentru a inhiba activitatea transpozonilor.
În celulele animalelor vertebrate, aproape toți cei peste 100.000 de transpozoni ADN dintr-un genom codifică polipeptide inactive. La om, toți transpozonii de tip Clasa I sunt inactivi. Primul transpozon de ADN utilizat ca instrument în scopuri genetice, sistemul de transpozoni Sleeping Beauty, a fost un transpozon care a fost resuscitat dintr-un somn evolutiv îndelungat.
Rolul în sistemul imunitar
Este posibil ca transpozonii să fi fost cooptați de sistemul imunitar al vertebratelor ca mijloc de producere a diversității anticorpilor: Sistemul de recombinare V(D)J funcționează printr-un mecanism similar cu cel al transpozonilor. Acesta este un sistem format din trei gene care se rearanjează în producția de limfocite la vertebrate. Sistemul codifică în mod divers proteine pentru a se potrivi cu antigene din bacterii, viruși, paraziți, celule disfuncționale, cum ar fi celulele tumorale, și polenuri.
Secvența finală de ADN și, prin urmare, secvența anticorpului, este foarte variabilă, chiar și atunci când sunt unite aceleași două segmente V, D sau J. Această mare diversitate permite recombinării VDJ să genereze anticorpi chiar și împotriva microbilor pe care nici organismul, nici strămoșii săi nu i-au întâlnit vreodată.