După atacul de la Pearl Harbor din 7 decembrie 1941, marina japoneză și forțele sale aeriene au fost înfrânte în mai multe bătălii importante, cum ar fi Midway și Marea Filipinelor. Au pierdut multe nave (inclusiv aproape toate portavioanele japoneze), sute de avioane de vânătoare și mulți dintre cei mai buni piloți ai lor. Industria japoneză era mică și foarte săracă în comparație cu cea americană. Din acest motiv, Statele Unite și-au înlocuit foarte repede navele și avioanele pierdute cu altele mai bune; dar Japonia nu putea face decât puține, și de proastă calitate. În perioada 1943-44, forțele aliate se îndreptau spre Japonia. În Bătălia din Marea Filipinelor, din 19-20 iunie 1944, forțele japoneze au fost împinse înapoi în Filipine.
La 15 iulie, Saipan (în Insulele Mariane de Nord) a fost capturată de forțele aliate. Capturarea Saipan a făcut posibil ca Forțele Aeriene ale Armatei Statelor Unite să atace chiar Japonia, folosind bombardiere B-29 Superfortress. După căderea Saipanului, comandanții japonezi știau că Aliații vor încerca să captureze Filipine în continuare. Filipinele erau foarte importante, deoarece se aflau între câmpurile petroliere din Asia de Sud-Est și Japonia. Dacă Japonia pierdea controlul asupra Filipinelor, ar fi rămas cu puțin combustibil pentru navele lor. Pe 17 octombrie, Aliații au început atacul asupra Filipinelor în Bătălia din Golful Leyte.
Viceamiralul Takijiro Onishi era la conducerea Forțelor Aeriene japoneze din Manila. Acesta a înțeles că era imposibil să câștige bătălia cu atât de puține avioane și piloți antrenați. Din acest motiv, a decis să formeze o forță de atac sinucigașă, Unitatea Specială de Atac. Un grup de 24 de studenți piloți s-a oferit voluntar pentru misiune. Forța Specială de Atac a fost organizată în 4 grupuri, Unitatea Shikishima, Unitatea Yamato, Unitatea Asahi și Unitatea Yamazakura. Aceste nume au fost preluate dintr-un poem patriotic (waka sau tanka), scris de poetul clasic japonez, Motoori Norinaga: (敷島の 大和心を 人問はば 朝日に匂う 山桜花). Poezia sună astfel: "În acest poem se citește: "Shikishima no Yamato-gokoro wo hito towaba, asahi ni niou yamazakura bana".
|  | Dacă cineva întreabă despre spiritul Yamato (spiritul Japoniei vechi/adevărate) din Shikishima (un nume poetic pentru Japonia) - este vorba despre florile de yamazakura (flori de cireș de munte) care sunt parfumate în Asahi (soarele care răsare). (O traducere mai puțin literală ar putea fi citită ca: Dacă cineva întreabă despre spiritul Japoniei, acesta este reprezentat de florile de cireș de munte care sunt parfumate în soarele care răsare. ) |  |
Japonezii au fost înfrânți în bătălia din Golful Leyte, dar forța Special Attack a avut un mare succes. Primul atac kamikaze a avut loc la 21 octombrie 1944, împotriva navei amiral a Marinei Regale Australiene, HMAS Australia. 30 de marinari au murit în atac, inclusiv căpitanul său Emile Dechaineux, iar mulți alții au fost răniți. Până la 26 octombrie, alte 47 de nave aliate fuseseră atacate. Cele mai multe dintre ele au fost grav avariate sau scufundate, precum portavionul american USS St. Lo.
Acest succes timpuriu i-a convins pe comandanții japonezi să continue atacurile kamikaze. Mulți alți piloți au fost recrutați pentru a acționa ca kamikaze. În următoarele câteva luni, mai mult de 2.000 de avioane au efectuat astfel de atacuri. Când stocul japonez de avioane a început să se reducă, au fost construite noi modele de calitate inferioară pentru aceste misiuni. Unele dintre ele, precum Nakajima Ki-115 Tsurugi, erau realizate în mare parte din lemn și foloseau stocuri de motoare mai vechi. Trenul de aterizare al avionului era, de obicei, abandonat de pilot după decolare, pentru a putea fi folosit de alte avioane, deoarece acesta nu urma să mai aterizeze din nou. Programe similare de atacuri sinucigașe au fost planificate, inclusiv bombe-rachetă cu pilot (numite Ohka) și torpile submarine (Kaiten).
Punctul culminant al atacurilor kamikaze a avut loc între 6 aprilie și 25 mai 1945, în timpul bătăliei de la Okinawa, în cadrul operațiunii Kikusui ("crizanteme plutitoare"). În această perioadă, au avut loc șapte valuri importante de atacuri, cu peste 1.500 de avioane kamikaze. Deoarece pregătirea lor fusese prea scurtă și avioanele lor erau prost făcute, piloții kamikaze au fost ținte ușoare pentru piloții aliați experimentați, care aveau și avioane mult mai bune. Dar, cu toate acestea, kamikaze care au scăpat de focul antiaerian și de avioanele de vânătoare inamice au provocat mari pagube flotei aliate. Aliații au câștigat bătălia, dar au pierdut multe nave și mulți oameni din cauza atacurilor kamikaze. Până la finalul bătăliei, cel puțin 21 de nave americane au fost scufundate de kamikaze. Unele nave din alte marine aliate au fost, de asemenea, scufundate, iar alte zeci au fost avariate.
Sute de avioane kamikaze suplimentare erau pregătite să apere Japonia de invazie. Cu toate acestea, odată cu capitularea Japoniei la 15 august, după bombardamentele atomice de la Hiroshima și Nagasaki și declarația de război a Uniunii Sovietice, acestea nu au mai fost folosite niciodată.