Geografia Columbiei are șase regiuni naturale principale, fiecare având propriile caracteristici unice. Regiunea muntoasă a Anzilor are granițe comune cu Ecuador și Venezuela. Regiunea coastei Pacificului are granițe cu Panama și Ecuador. Regiunea de coastă din Caraibe are granițe comune cu Venezuela și Panama. Llanos (câmpiile) are graniță comună cu Venezuela. Regiunea pădurii tropicale amazoniene are graniță comună cu Venezuela, Brazilia, Peru și Ecuador. Regiunea insulară include toate insulele țării.
Principalele râuri din Columbia sunt Magdalena, Cauca, Guaviare, Guaviare, Atrato, Meta, Putumayo și Caquetá. Columbia are patru sisteme principale de drenaj: drenajul Pacificului, drenajul Caraibelor, bazinul Orinoco și bazinul Amazonului.
Cea mai mare parte a populației trăiește în regiunea Anzilor. Dar câmpiile reprezintă peste jumătate din teritoriu. Doar aproximativ 6% din populație trăiește în câmpii. Lanțul muntos Sierra Nevada de Santa Marta include cele mai înalte vârfuri din țară (Pico Cristóbal Colón și Pico Simón Bolívar).
Clima
Temperatura din Columbia se schimbă în funcție de altitudine, iar temperatura diferă în funcție de regiune. Regiunile din jurul Anzilor sunt mai reci decât coasta, care este mai joasă.
Din cauza altitudinilor numeroase, Columbia are multe fructe, legume și tipuri de animale diferite. Are multe văi, plaje, câmpii, munți și păduri, cum ar fi pădurea amazoniană.
Vârful unora dintre munții din Columbia este atât de rece încât oamenii pot schia peste ecuator. Munții mai joși au un climat mai cald. Țărmurile mării sunt răcite de briza oceanului. La nivelul mării, aproape de ecuator, este cald.
Râurile sunt importante ca căi navigabile pentru transportul de mărfuri. Unul dintre cele mai importante râuri din Columbia este Magdalena-Cauca. Râul Magdelena împarte munții din est și cei din centru. Acesta formează o vale fertilă. Râul Cauca împarte munții din centru și creasta vestică, făcând o altă vale mare. Cauca este de fapt o parte din Magdalena. Cu toate acestea, cele două nu se întâlnesc decât cu câțiva kilometri înainte ca Magdalena să intre în Marea Caraibelor.
Biodiversitate
Columbia este o țară megadiversă. Acest lucru înseamnă că țara găzduiește majoritatea speciilor de pe Pământ. Există, de asemenea, un număr mare de specii endemice.
Columbia are 1.900 de specii de păsări, mai multe decât orice altă țară. Există aproximativ 2.000 de specii de pești marini. Este a doua cea mai diversă țară în ceea ce privește peștii de apă dulce. În ceea ce privește plantele, țara are între 40.000 și 45.000 de specii. Columbia se află pe locul al doilea în ceea ce privește numărul de specii de amfibieni și este a treia cea mai diversă țară în ceea ce privește reptilele. Există aproximativ 2.900 de specii de moluște și aproximativ 300.000 de specii de nevertebrate.