Zooxanthellae
Unele dinoflagelate sunt zooxantelate: endosimbionți ai eucariotelor marine și ai animalelor, cum ar fi coralii antozoari. Acești corali care construiesc recifuri depind în mare măsură de ele. Alte organisme care pot găzdui zooxantehelii sunt meduzele, scoicile, foraminiferele, melcii de mare, adică nudibranhiile, precum și ciliții și radiolarii.
Mareele roșii
Dinoflagelatele sunt responsabile de "mareele roșii" care pot otrăvi peștii. Uneori, acestea înfloresc în concentrații de peste un milion de celule pe mililitru. Unele specii produc neurotoxine care, în cantități atât de mari, ucid peștii și se acumulează în alimentele cu filtru, cum ar fi crustaceele, care, la rândul lor, le pot transmite oamenilor care le consumă. Acest fenomen se numește maree roșie, de la culoarea pe care înflorirea o conferă apei. Nu toate înfloririle de dinoflagelate sunt periculoase. Pâlpâirile albăstrui vizibile în apa oceanului pe timp de noapte provin adesea de la înfloririle de dinoflagelate bioluminescente, care emit scurte sclipiri de lumină atunci când sunt deranjate.
Clasificare
Deși sunt clasificate ca eucariote, nucleelor dinoflagelatelor le lipsesc unele caracteristici cheie ale nucleelor eucariote. De fapt, Dodge a denumit nucleul dinoflagelatelor drept mezocariot, datorită faptului că posedă caracteristici intermediare între zonele de ADN înfășurate ale bacteriilor procariote și nucleul eucariot bine definit. Cu toate acestea, acest grup conține organite tipic eucariote, cum ar fi complexele golgi, mitocondriile și cloroplastele.
Acest grup conține multe organite și moduri de viață complexe. Unele au structuri asemănătoare cu ochii vertebratelor; unele au nematociste; unele trăiesc sub formă de plasmodii (forme multinucleate); unele au doi flageli; dinoflagelatele fotosintetice conțin o "gamă deconcertantă" de tipuri de plastide; iar întreaga lor genetică și biologie celulară este excentrică.
Fosile
Dinoflagelatele fosile sunt importante în stratigrafie, în datarea și corelarea straturilor. În timpul vieții lor, dinoflagelatele au o formă planctonică mobilă și o fază de chist rezistent care le permite să supraviețuiască peste iarnă în sedimente. Numai chistul se fosilizează. Prima lor apariție certă este în perioada Silurianului, cu o mare radiație în era mezozoică. p440Margulis și colegii săi le-au clasificat în Phylum Dinomastigota.