Florida este un stat cu o mare diversitate biologică, cu 3.500 de plante vasculare native și 1.500 de vertebrate, un număr mai mare decât în toate celelalte state, cu excepția a trei. Un studiu realizat în 2003 de Organizația Națiunilor Unite pentru Alimentație și Agricultură a afirmat că Strâmtoarea Florida are cea mai mare biodiversitate din Oceanul Atlantic și că găzduiește 25 de specii endemice.
Flora
Mareea roșie a fost, de asemenea, o problemă pe coasta de sud-vest a Floridei. Deși au existat multe presupuneri cu privire la cauza înfloririi algelor toxice, nu există nicio dovadă că aceasta ar fi cauzată de poluare sau că a existat o creștere a duratei sau a frecvenței epidemiilor de maree roșie.
Dăunători florali
Flora autohtonă este amenințată de diverse plante invazive, printre care și piperul brazilian (Schinus terebinthifolius). Deținerea și cultivarea acestui arbore este ilegală. Un număr mare de voluntari taie aceste invadatoare, în special de-a lungul cursurilor de apă. Pinul australian (Casuarina spp.) este atacat în mod activ.
Printre alți dăunători străini se numără gândacul asiatic al ambroziei (Xyleborus glabratus), care amenință industria locală de avocado și arborele roșu (Persea borbonia).
Este ilegală importarea melcilor uriași africani de uscat (achatina fulica). Aceștia amenință clădirile, 500 de tipuri de plante locale și sunt purtători de meningită.
Fauna
Printre speciile endemice din Florida se numără jderul de Florida (Aphelocoma coerulescens), cerbul albastru de Miami (Cyclargus thomasi bethunebakeri), săgetătorul de Okaloosa (Etheostoma okaloosae) și cerbul Key (Odocoileus virginianus clavium).
Florida este o destinație populară pentru observarea păsărilor, datorită numeroaselor specii care pot fi găsite în acest stat în diferite perioade ale anului. Societatea Ornitologică din Florida menține lista oficială de stat a păsărilor din Florida, care conține în prezent 498 de specii. Un studiu publicat în 2003 de Florida Fish and Wildlife Conservation Commission a documentat 196 de specii de păsări a căror reproducere a fost confirmată în acest stat, alte 19 specii fiind enumerate ca fiind posibile sau probabile. Great Florida Birding Trail, un traseu de 3.200 km (2.000 de mile), este compus din 489 de locații din întregul stat, care sunt locuri excelente de observare.
Pescuitul sportiv este, de asemenea, popular în Florida; în Florida se găsesc peste 250 de specii diferite de pești (inclusiv 73 de specii alogene). Există peste 1.000 de specii de pești în apele de coastă din Florida.
În 2010, NOAA, invocând Legea Magnuson-Stevens, a interzis pescuitul de roșioară până când populația va avea timp să se refacă.
Coasta atlantică a Floridei găzduiește singurele recife de corali extinse din Statele Unite continentale și a treia ca mărime din lume. Întregul sistem de recife din Florida Keys face parte din Sanctuarul marin național Florida Keys, iar părți mari de recif sunt protejate ca parte a Parcului Național Biscayne.
În 1977, guvernul federal a inclus aligatorii pe lista speciilor pe cale de dispariție. Aceștia au fost scoși de pe lista speciilor pe cale de dispariție în 1987, iar Florida a permis vânătoarea selectivă în 1988.
Habitate pentru păsări și broaște țestoase
În 1987, Brevard County, Florida, a găzduit ultimul membru al speciei Dusky Seaside Sparrow, acum dispărută. Au existat doar două specii de păsări dispărute de la începutul listării speciilor pe cale de dispariție, în 1973. Acest eveniment a reprezentat o provocare pentru a se asigura că alte probleme de mediu sunt abordate rapid.
De mulți ani, s-a considerat că această specie este amenințată, deoarece specia este teritorială și nu se poate deplasa către un loc mai bun atunci când habitatul său este în pericol.
Plajele de cuibărit ale broaștelor țestoase țestoase de mare sunt protejate.